调教 使用python绘图列线图
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列线图是临床量度模子必不可少的元素,当今绘图列线图在R谈话中长短常大要的事情,况兼有各式密致的顺序,可是你知谈若何使用python绘图列线图吗?
今天给各人先容一个可以绘图列线图的python库,名字是:simpleNomo。
这个包可以径直使用excel文献进行绘图列线图,表面上唯有是可以筹谋变量整个的模子皆能使用,嗅觉也曾挺大要的。
装配调教环境需求:
pandas==1.2.4numpy==1.21.5matplotlib==3.5.1
装配,没改镜像的紧记先修改pip镜像,否则可能会装配失败哦:
pip install simpleNomo使用简介
就一个函数,使用形势如下:
nomogram(path, result_title="Positive Risk", fig_width=10, single_height=0.45, dpi=300, ax_para = {"c":"black", "linewidth":1.3, "linestyle": "-"}, tick_para = {"direction": 'in', "length": 3, "width": 1.5,}, xtick_para = {"fontsize": 10, "fontfamily": "Songti Sc", "fontweight": "bold"}, ylabel_para = {"fontsize": 12, "fontname": "Songti Sc", "labelpad":100, "loc": "center", "color": "black", "rotation":"horizontal"}, total_point=100)
主若是谈判一下字体、标签啥的,和R谈话中各式列线图的丰富选项是不可比的哈~
底下是使用演示,最初需要我方准备一个excel文献,这个template.xlsx文献实践长这么:
明星换脸图片
然后径直用即可:
import simpleNomo as snpath = "../000files/nomogram-main/template.xlsx"fig = sn.nomogram(path = path)
出图如下:
图片
作家合计比拟于R和SAS,这个包绘图列线图的上风是可以走漏risk,这是其他形势不具备的。
使用时紧记援用文献:
Hong, H., & Hong, S. (2023). simpleNomo: A Python Package of Making Nomograms for Visualizable Calculation of Logistic Regression Models. Health Data Science, 3, 0023.
这个文献中还比较了一下和SAS、R中绘图列线图的异同:
图片
是以你会使用这个python库绘图列线图吗?调教
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