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调教 使用python绘图列线图 - U系大作战2

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调教 使用python绘图列线图

调教 使用python绘图列线图

💡专注R谈话在🩺生物医学中的使用调教

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列线图是临床量度模子必不可少的元素,当今绘图列线图在R谈话中长短常大要的事情,况兼有各式密致的顺序,可是你知谈若何使用python绘图列线图吗?

今天给各人先容一个可以绘图列线图的python库,名字是:simpleNomo。

这个包可以径直使用excel文献进行绘图列线图,表面上唯有是可以筹谋变量整个的模子皆能使用,嗅觉也曾挺大要的。

装配调教

环境需求:

pandas==1.2.4numpy==1.21.5matplotlib==3.5.1

装配,没改镜像的紧记先修改pip镜像,否则可能会装配失败哦:

pip install simpleNomo
使用简介

就一个函数,使用形势如下:

nomogram(path, result_title="Positive Risk", fig_width=10, single_height=0.45, dpi=300,         ax_para = {"c":"black", "linewidth":1.3, "linestyle": "-"},         tick_para = {"direction": 'in', "length": 3, "width": 1.5,},         xtick_para = {"fontsize": 10, "fontfamily": "Songti Sc", "fontweight": "bold"},         ylabel_para = {"fontsize": 12, "fontname": "Songti Sc", "labelpad":100,                         "loc": "center", "color": "black", "rotation":"horizontal"},         total_point=100)

主若是谈判一下字体、标签啥的,和R谈话中各式列线图的丰富选项是不可比的哈~

底下是使用演示,最初需要我方准备一个excel文献,这个template.xlsx文献实践长这么:

明星换脸

图片

然后径直用即可:

import simpleNomo as snpath = "../000files/nomogram-main/template.xlsx"fig = sn.nomogram(path = path)

出图如下:

图片

作家合计比拟于R和SAS,这个包绘图列线图的上风是可以走漏risk,这是其他形势不具备的。

使用时紧记援用文献:

Hong, H., & Hong, S. (2023). simpleNomo: A Python Package of Making Nomograms for Visualizable Calculation of Logistic Regression Models. Health Data Science, 3, 0023.

这个文献中还比较了一下和SAS、R中绘图列线图的异同:

图片

是以你会使用这个python库绘图列线图吗?调教

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